6架B -29轰炸机被分配给了这次任务。斯维尼和弗雷德里克·C·博克(Frederick C. Bock)上尉交换了飞机,斯维尼会驾驶"博克疤痕"号携带原子弹,并作为领航机,飞机上增加了三名任务专家,一名雷达对抗操作员和两名负责原子弹的军官。"伟大的艺术家"仍然充当仪器飞机。为避免被认为是投放原子弹飞机,6架B -29没有标上509大队的箭头标志,而是标上了第44轰炸大队的标志。每一架执行任务的飞机的机头上都没有涂鸦和机名。
轰炸机大队行动军官小詹姆斯·I·霍普金斯中校(Lt. Col. James I. Hopkins Jr.)驾驶名为"大恶臭"(Big smell)的观察/摄影飞机。霍普金斯的态度不佳,因为任务指挥官军衔比他低。还有两架气象飞机,乔治·马夸特(George Marquardt)上尉驾驶的"埃诺拉·盖伊"(Enola Gay)报告主要目标小仓上空的天气情况,查尔斯·F·麦克奈特(Charles F. McKnight)上尉驾驶的"拉格金巨龙"(Laggin ' Dragon)将在长崎侦察天气。第六架B-29轰炸机部署在硫磺岛,作为备用飞机。