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[闲聊] 奥密克戎又变异，混合病毒XE来势汹汹

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豚连姆斯 发表于 2022-4-17 05:47:29 | 只看该作者 打印 上一主题 下一主题
 
新冠病毒（SARS-CoV-2）是一个非常狡猾的病毒，虽然结构很简单，却一直不停在变异。

迄今为止，新冠病毒通过不断变异，已经拥有不少“分身”[1]：


  • 阿尔法（Alpha）：最早于2020年9月在英国被发现，感染这一变异株后，病情重，死亡率高，但免疫逃逸程度低，免疫系统能够识别它并进行攻击。
  • 贝塔（Beta）：最早于2020年5月在南非被发现，这一变异株传播力强，但病情通常不会很重。
  • 伽马（Gamma）：最早于2020年11月在巴西被发现，这一变异株引发重症和危重症的比例高。
  • 德尔塔（Delta）：最早于2020年10月在印度被发现，这又是一个传播力强的变异株。
  • 奥密克戎（Omicron）：最早于2021年11月在南非被发现，这是一个传染性很强的变异株，而且感染后症状不典型，隐匿性高，容易漏诊。

目前，全球范围内的主要流行毒株就是奥密克戎。它可是个“狠角色”，传播速度快、传染性强且传播隐匿，且有BA.1和BA.2两个“大名鼎鼎”的分身。

目前在我国上海、吉林等地肆虐的主要毒株就是Omicron子变体BA.2。

奥密克戎又变异，混合病毒XE来势汹汹 第1张图片

近日，英国卫生安全局（UKHSA）发布的报告中，提到了3种新冠病毒的重组变体——XD、XE和XF[2]。

重组变体，指的是几种流行变异株合并形成的新毒株，相当于毒上加毒。

重组变体其实并不罕见，当机体同时感染2种或2种以上的新冠变种时，就可能产生重组变体。但绝大多数的重组变体会很快消亡，留存下来的，一般都是具有毒力和传播优势的毒株。

我们可以通过下图，了解此次报告的XD、XE和XF这3个重组变体。

奥密克戎又变异，混合病毒XE来势汹汹 第2张图片
（图1  XD、XE、XD重组序列展示[2] ）

从图中我们可以得出以下信息：


  • 第1排橙色展示了SARS-CoV-2的基因组全长；
  • 第2排用红色、黄色、橙色代表SARS-CoV-2的基因组成；
  • 第3排绿色代表了变异毒株Delta的基因组；
  • 第4排深紫代表了变异毒株Omicron BA.1的基因组；
  • 第5排浅紫代表了变异毒株Omicron BA.2的基因组；
  • XD和XF变体均为Omicron BA.1 和 Delta 变体的重组，但组合方式不同，因此形成了不同的变异体；
  • XE变体则是Omicron BA.1 和BA.2的合体。

在这3种重组变体中，最受关注的是XE。主要的原因在于它的传播力很强，传播速度比BA.2还快9.8%，有可能造成大范围的流行[2]。

截至今年3月22日，英国境内已发现637例XE感染病例，我国香港在今年2月，就有发现两名抵港旅客感染奥密克戎混合病毒XE，还好经过隔离，没有流入社区[3]。

奥密克戎又变异，混合病毒XE来势汹汹 第3张图片

在报告中，研究人员评估了XE的增长率。增长率是一个衡量感染确诊速度的指标。通过它，我们可以了解XE的传播率有多强。

在此之前，BA.2的增长率比其他奥密克戎菌株高75%。但XE的增长率却比BA.2还高出9.8%。

这意味着，XE传播速度会比BA.2还要快，有可能会引发新的大规模流行[2]。

奥密克戎又变异，混合病毒XE来势汹汹 第4张图片
（图2  XE与BA.2的增长率比较[2] ）

对于XE感染后的严重程度（重症率、死亡率）以及免疫逃逸情况，目前还没有足够的证据。但仅从传播力上看，XE绝对是个不容小觑的变异体。WHO也发出警告，千万不要轻视或低估重组毒株的危险性[2]。

奥密克戎又变异，混合病毒XE来势汹汹 第5张图片

抗原检测好使吗？

抗原检测，也就是目前可以进行家庭检测的抗原试剂盒，会检测样本中的新冠病毒的核衣壳蛋白（NP）。新冠病毒发生变异后，核衣壳蛋白的相对位置也可能发生突变（如下表所示）。

奥密克戎又变异，混合病毒XE来势汹汹 第6张图片
（表1 新冠变异株的核衣壳蛋白突变[4]）

有抗原检测研究比较了其对不同变异体的检测能力，发现抗原检测敏感性与原始毒株相比只有微小的差异。

奥密克戎又变异，混合病毒XE来势汹汹 第7张图片
（图3  某抗原检测对新冠病毒变异株的检测性能比较[4]）

尽管目前尚无抗原检测对XE敏感性的证据，但基于之前研究的数据推断，抗原检测应该能够检测出XE感染。

核酸检测仍是最可靠的法子

核酸检测，可以直接检测病毒核酸来判断是否感染，在进行新冠病毒检测时，会对病毒核酸的多个靶点（ORF1ab基因、N基因、S基因）进行检测。

面对奥密克戎时，核酸测试无法检测到靶基因中的S基因，这被称为S基因缺失或S基因靶标失效（S-Gene Target FAIlure , SGTF）。也正是通过这个方式，检查者能够把奥密克戎和其他变异体区分开[2]。

但奥密克戎变异体BA.2的出现，使得它不再具有所谓“S基因缺失”特征，导致其刚出现时一度“隐形”。不过，随着对它了解的加深，调整检测方式后，核酸检测是能够检出BA.2的。

此次英国发现的XE感染病例都是通过核酸检测确诊的，因此，大家可以放心，核酸检测是能够查出XE的感染情况。

奥密克戎又变异，混合病毒XE来势汹汹 第8张图片

迄今，还没有足够证据了解疫苗对这一变种的效果。但疫苗对于奥密克戎的有效性，已经得到了多项研究的验证。

3月22日，香港大学发布的研究，评估了复必泰（即辉瑞/BioNTech疫苗）与科兴两种疫苗对奥密克戎的有效性。

研究结果显示，无论复必泰还是科兴，接种后都能减少感染奥密克戎后重症或死亡的风险，而且仅接种一针，就可以见效[5]。

奥密克戎又变异，混合病毒XE来势汹汹 第9张图片
（图4  新冠疫苗对奥密克戎的有效性[5]）

可见，对于目前主导流行的BA.2，疫苗是能发挥有效防护作用的。XE作为BA.1和BA.2的合体，疫苗效果尽管尚不明确，但不能因此而拒绝疫苗接种。进行规范的疫苗接种，仍是保护自己的最有力手段之一。

除了接种疫苗，做好日常防护，减少流动、科学理性的对待新冠肺炎给我们带来的各种医学问题，也有助于我们更好地保护自己。

参考文献
[1].https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
[2].https://www.gov.uk/government/publications/investigation-of-sars-cov-2-variants-technical-briefings
[3].https://news.sina.cn/gn/2022-04-02/detail-imcwiwss9503449.d.html
[4].Weishampel ZA， Young J， Fischl M， Fischer RJ， et al. OraSure InteliSwab  Rapid Antigen Test performance with the SARS-CoV-2 Variants of Concern Alpha， Beta， Gamma， Delta， and Omicron. medRxiv
[5].http://www.med.hku.hk/en/news/press//-/media/HKU-Med-Fac/News/slides/20220322-wave_5_omicron_PHSM_update_final.ashx


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标签：英国巴西香港免疫系统奥密克戎
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