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[闲聊] 新冠病毒一共有多少变异体？

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7861384 发表于 2022-5-14 21:50:46 | 只看该作者 打印 上一主题 下一主题
 
对于新冠病毒，大众听过最多的名字有贝塔（Beta）、德尔塔（Delta）和奥秘克绒（Omicron），实际上，截至2022年4月26日，仅能查到的病毒大类就至少有11种，基本都用希腊字母命名，每一个大类中又有许多分支，其总数很难统计，分支一般用Pango Lineage来命名。

新冠病毒一共有多少变异体？ 第1张图片

每一个被圈住的希腊字母都是一个病毒大类，留给我们的命名空间不多了

资料来源：SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions
常见毒株介绍

Alpha（B1.1.7）


新冠病毒一共有多少变异体？ 第2张图片

新冠病毒Alpha变异株

Alpha变异株最早出现在2020年的英国，GISAID公开数据显示该毒株最早样品日期是2020年9月3日。同年11月，Alpha变异株在英国爆发感染，并最终扩散至全世界，美国尤其严重。
感染性

Alpha毒株变异了几个突刺（Spike），相比于原始病毒，感染力提高了30%~50%。CDC数据显示，截至2021年4月中旬，全美所有感染病例中有66%是Alpha毒株的感染，之后Delta毒株兴起，Alpha才渐渐淡出视野。
严重性

研究显示，Alpha变异毒株相比于原始病毒，传染率更高，致死率也略高一些。
Beta（B.1.351）


新冠病毒一共有多少变异体？ 第3张图片

新冠病毒Beta变异株

Beta变异株最早出现在南非，cov-lineages资料显示，Beta变异株最早样本时间在2020年9月1号，与Alpha变异株发现的时间差不多，甚至略早。可能由于英国更高的流通性导致Alpha更早地扩散到了全世界，姗姗来迟的南非变异株只能被命名为Beta。
传染性

与原始毒株相比，Beta变异株的传染性大约高了50%。
严重性

Beta变异株的几个变异可能会让它拥有清除抗体的能力，而抗体是免疫系统识别病毒的重要标志，这使得Beta变异株可能更容易逃过免疫系统的追捕。
Delta（B.1.617.2）


新冠病毒一共有多少变异体？ 第4张图片

新冠病毒Delta变异株

Delta变异株最早出现在印度，cov-lineages资料显示该毒株最早样本时间在2021年3月1号。自病毒被发现不久，Delta毒株便迅速爆发并扩散至全世界，很快便取代了Alpha变异株在美国的位置。
传染性

统计表明，Delta变异株造成的感染数量大约是此前所有病毒感染病例的两倍。与此前的Alpha变异株相比，Delta变异株的感染性大约提高了80%~90%。从美国的相关报道来看，2021年秋季，那时全美大部分人已经接种了疫苗，Delta仍然在美国掀起了大规模的病毒感染。
严重性


从实际情况来看，即使接种了疫苗也仍然不能完全抵抗Delta变异株的感染，对于没有接种疫苗的人来说，Delta变异株更容易引起重症。一份来自《柳叶刀》的报告显示，在英国，Delta变异株感染重症的风险大约是Alpha变异株感染的两倍。
Omicron（B1.1.529）


新冠病毒一共有多少变异体？ 第5张图片

Omicron变异株

我们目前为止听得较多的奥秘克绒（Omicron），cov-lineages资料显示该毒株最早检测时间在2021年9月7号，发现于南非。在美国的所有感染病例中，目前Omicron占绝大多数，同时最近上海的疫情也基本是Omicron感染。
传染性

Omicron传染性非常高，病毒中发现了30多个变异位点，其中一些变异增强了病毒的感染力，特别对那些已经感染过病毒且没有接种疫苗的人来说，Omicron能够消除感染者身体里的免疫反应，使得患者更容易复阳，进而更容易传播。
严重性

虽然Omicron的传染性很高，但致死率低得多。相比于此前其他的新冠变异株，Omicron感染的症状相对较轻，对于接种疫苗的普通人而言，无症状更为常见，可以看到上海每日新增的大部分都是无症状的感染者。
虽然如此，也并不是说Omicron不会造成重症，运气不好感染Omicron后住进ICU甚至死亡的也有，特别是那些原本身体就欠佳的普通人，感染Omicron后风险仍然很大。
更多的病毒

以上是较知名的几种新冠变异毒株，实际上，文章开头的图片中，红圈中圈出来的字母都用来命名了病毒，除了以上四种以外还有Alpha、Gamma、Mu、Kappa等十几种，平日里只有在物理学领域才能见到的字母，一次疫情就差不多用掉了一半。

新冠病毒一共有多少变异体？ 第6张图片

新冠病毒分布图

即使如此，希腊字母也只能用于命名病毒的大类，实际上每一个大类的背后，都有很多个小类，也就是说Omicron不是指的一种病毒，而是好几种或者是十几种病毒的统称，而这样的情况在其他的希腊字母中也同样存在，所以算起来，真正的病毒数量应该是有好几十甚至上百种。
怎么体现呢？这就要扯到Pango命名。
Pango命名

有注意到病毒名称后面括号里的字母加数字了吗，那就是Pango命名，这是一种按照“谱系”逻辑来命名的方案。开头的字母代表了谱系（或者家族），也就是一个大类，后面的数字表示同一个大类里面的不同变异体。
举个例子，把A代表苹果，A1可以认为是红苹果，A2可以认为是青苹果，但它们都属于苹果。
同时，数字越多，谱系延申得越长，比如A1.1可以认为是红苹果里面的脆苹果，A1.2可以认为是红苹果里面的沙苹果，但它们都是红苹果，更属于苹果。
病毒也是这个道理，以Omicron（ B1.1.529）为例，B1代表了一个大类，B1.1则是在B1的基础上变异了一点点，B1.1.529就是在B1.1的基础上进一步有变异，这就已经是3种病毒了。

新冠病毒一共有多少变异体？ 第7张图片

各种病毒及其pango命名

Pango的官网在这里，有兴趣可以去了解：https://cov-lineages.org/index.html
病毒变异

变异原理（mutation）

病毒感染宿主之后会利用宿主身体内的原料来复制自身，进而扩散病毒的数量，所有的病毒都如此。
所谓变异，指的就是基因的变化，所以在复制的过程中，关键是病毒基因的复制。一般的基因是两条链条两两相连配成一对，复制的时候一对基因分裂成两条，然后细胞会分别为这两条单链各自合成一条链来匹配它们，最终成为两对基因，就像离婚的两口子，各自又成了家。
这样做的好处在于，两个链条之间的匹配机制是固定的，一旦其中有一条链出现问题，两条链就无法组合成一对有效的基因，保证了基因复制的正确性，也就降低了变异的概率。
包括人在内的大部分生物的基因都是成对存在。

新冠病毒一共有多少变异体？ 第8张图片

DNA复制过程


但有一些特殊病毒的基因不是两两成对，而是只有一条，比如艾滋病病毒、埃博拉病毒和新冠病毒。
由于它的基因只有一条，复制起来也相对简单，同时它不需要另一条链条来成对匹配，也就没有了纠错机制，就算复制错了也检查不到，所以新冠病毒才呈现出这么高的变异性。
可以预见，如果不加控制，新冠病毒还有可能再次变异。
变异方向

新冠传到Omicron这一代，重症已经很少了，是不是说明病毒越变异，危害越小？
并不是
首先，人类对于病毒的了解还不够多，感染病毒之后身体具体会有哪些反应，对身体其他器官又有何影响，我们还并不清楚。比如已知的一些病毒或者细菌感染后，某些癌症的发病率会上升，像幽门螺旋杆菌，EB病毒，HVP病毒等，它们直接引起的症状也不算很严重，但你防不防呢？
同理，新冠也是如此，虽然目前感染的症状已经很轻了，但我们不了解它是否会有其他影响，比如会不会导致肺癌、肝癌的发病率上升？不知道~所以别那么大胆。
第二，病毒的变异是随机的，具体变异的结果大概率是【传播率越来越高，但致死率越来越低】，而这个结果是环境选择的。
所以真实的情况是，病毒陆陆续续变异出很多代，在这些病毒中，传播率，致死率有高有低，这就是个排列组合的数学问题。但是，由于致死率高的病毒，宿主死得太快，活动范围受限，所以这种病毒并不能大规模传播，相反，那些致死率低的病毒，其携带者能够到处活动，接触的人也更多，病毒感染的范围才会越来越广，埃博拉病毒就是死亡率太高，才很难大规模扩散。
所以之所以现在的病毒是Omicron为主流，只是因为它活下来了，其他致死率高的病毒没有传播开，被环境淘汰了，这也是进化论的体现。
所以结果好像还是那个答案，病毒正在变得越来越弱，但可以掉以轻心吗？
这里就不得不注意一个盲点，虽然从结果上来看，病毒确实在越来越弱，但前面也说了，致死率高的变异不是没有，只是因为在这个过程中由于宿主死得早所以没传播出去。
那问题来了，万一你就是下一个高致死率的宿主呢？
最近上海一直在隔离，一直在静默，许多企业也因此停工，影响了收入，被波及的大众难免会有不愉快的情绪，为了经济效益产生与病毒共存的念头。希望这篇内容能够加深大家对病毒和变异的了解，认识到现阶段抗疫是正确的做法，能更加积极地配合政府的抗疫工作。
绝对不能够与病毒共存，清0是必须要达到的目标，只有这样才能够阻止病毒的泛滥，才能够阻止病毒产生更多的变异，才能够消灭更多潜在的危险，毕竟没有任何一个人希望成为那个随机的高致死率的病毒宿主。
欢迎转发
部分资料和数据引用于
[1]Omicron, Delta, Alpha, and More: What To Know About the Coronavirus Variants，KATHY KATELLA，2022-04-20
[2]SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions，CDC，2022-04-26
[3]https://cov-lineages.org/lineage_list.html


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