马来西亚的特殊教育始于民间和宗教团体活动，在独立后特殊教育才受到政府更多的重视，逐步走上正轨，并日臻完善。马来西亚特殊教育发展大致可以分为四个阶段，即萌芽阶段（1900年以前）、初创阶段（1900-1957年）、发展阶段（1957-1990年）、完善阶段（1990年至今）。在萌芽阶段，马来仍处于英属殖民地时期，只有马来人开设的微型宗教学校为穷人和残障人士开设教学课程，这些学校大部分在农村开办，教授内容以宗教知识和道德修养为主，目的在于最低限度的帮扶困难群体扫除文盲，培养具有基本生存能力的社会底层人民。这一时期马来的特殊教育没有受到社会太多的关注和帮扶，发展缓慢且滞后。在初创阶段，民间个人、机构以及宗教团体对特殊教育有所投入，1926年，马来西亚第一所专门接受视障儿童入学的学校建立标志着马来西亚特殊教育的开始，但这个阶段的特殊教育还是非官方的，被排除在国民教育体系。
在1957年马来独立后，马来联邦政府将特殊教育整合到国民教育体系中。在政府的综合管理中，开设了专门的特殊学校，也力图推动非二元制的混合模式，让特殊儿童与正常儿童一起接受教育。政府不仅号召全社会都来支持特殊教育事业，同时也加大特殊教育领域的财政拨款。这一时期，马来西亚的特殊教育得到联邦政府的支持，发展速度较快，态势良好。1994年联合国教科文组织在西班牙召开的世界特殊教育大会中发表了《萨拉曼卡宣言》（Salamanca Statement），首次正式提出全纳教育的理念，呼吁全世界各国广泛开展全纳教育，并为特殊教育的未来发展与完善指明了方向。马来西亚积极响应号召，1995年设立特殊教育部门（Special Education Department，后来升格为“特殊教育厅”即“Special Education Division”）。次年，政府在颁布的《教育法》中有一章专门介绍特殊教育。特殊教育成为马来西亚国民教育体系的一部分，并正式得到了官方的认证，民间、私人机构等特殊教育也有了法律依据。1997年，马来西亚出台了关于特殊教育的《教育法规》（Education Rules），指明了马来西亚学校发展的3项规划，即特殊学校规划、混合教育规划以及全纳教育规划。除了联邦政府主导开办特殊教育学校（Sekolah Kebangsaan Pendidikan Khas），不受政府财政拨款的独立华文学校也响应号召，如槟榔屿州的崇光学校于2011年首次在华校开设“特殊教育班”，这说明马来西亚特殊教育已经不再局限于公立学校，私立学校也已经开始特殊教育改革。
除此之外，马来西亚政府也重视推进特殊教育领域的国际交流，东南亚教育部长组织为了满足不同类型的残疾儿童、天才和超常儿童的教育需求，在马来西亚森美兰州设置特殊教育区域中心（Regional Centre for Special Education, 简称SEAMEO SEN），为来自东盟成员的教育人士提供特殊教育培训课程，为求关注并解决地方对特殊教育的需求。至此，马来西亚特殊教育政府国内推动和国际合作中得到进一步完善和发展。
马来西亚在特殊教育工作推进中重视师资培养和培训，一方面在高校设置了特殊教育专业，例如位于霹雳州的公立大学苏丹伊德里斯师范大学提供专门的特殊教育课程，学生可以获得相关的学历学位。另一方面，还提供了非全日制的特殊教育进修课程，候选人通过为期12个月的培训，可获得高级特殊教育专业认证 （ADISE），这个项目专门用于培训有意向从事特殊教学工作的求职者。
正是由于马来西亚联邦政府和民间团体的努力，马来西亚残障儿童和特殊人群拥有接受国民教育的机会。他们在学习期间可以选择学习技术的职业教育，也可以到高等学府进行深造，教育形式根据学生的具体情况而定。随着马来西亚教育事业发展，特殊社会群体受到了高度关注和大力帮扶，马来西亚政府倡导的社会对弱势群体的帮助和关爱，这体现了马来西亚宗教导向下的政府和国民社会道德感和责任感逐步提升，追求教育公平的步伐向前迈进，也向全世界展现了日趋成熟且充满活力的马来西亚教育体系。
尽管马来西亚特殊教育体系发展态势良好，但目前仍存在一些问题。例如特殊教育资源匮乏、多元学科合作缺失、特殊项目评价滞后、配套服务水平较低、流行病学数据不足等诸多亟待解决的问题。相比发达国家的特殊教育，马来西亚特殊教育教师入职门槛不高，特殊教育师资质量有待进一步提高，以确保教学水平，让特殊学生群体接受高质量的教育。
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