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[闲聊] 如何看待新冠「拉姆达」变异毒株或可逃避中和抗体？人类想要战胜疫情该怎样努力？

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一条臭咸鱼 发表于 2021-8-7 05:51:16 | 只看该作者 打印 上一主题 下一主题
 
日本研究人员近日在美国生物学开放获取预印本平台 (BioRxiv) 上刊文指出，新冠病毒的拉姆达 (λ) 变异毒株不仅具有高度传染性，而且有可能逃避中和抗体。
2020 年 8 月，科学家首次在秘鲁发现了一种新冠病毒变异毒株 C.37，世卫组织将其命名为「拉姆达」，这种变异毒株自从在秘鲁被发现后迅速传播。6 月 14 日，世卫组织将其归为「关注变种」 (VOI) 。目前，这一变种已经扩散至30多个国家，在南美国家的传播率尤高，占整个秘鲁新增病例的约 81%，智利感染该变种的患者也达到新增病例的约 1/3。6 月 25 日，英国公共卫生部报告了 6 例拉姆达变种病例，均与海外旅行有关。
在最新研究中，日本东京大学和大阪大学研究人员称，拉姆达变种的刺突蛋白具有高度传染性，而导致这种高传染性的「罪魁祸首」是该病毒出现的 T61 和 L452Q 两个突变，这两个突变改变了该变种与血管紧张素转化酶 2 （ACE2） 细胞受体结合的性质。
相关报道：


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标签：英国日本南美海外旅行
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沙发
烟火绝客不眠 发表于 2021-8-7 05:51:22 | 只看该作者
 
老夫来贩卖一点焦虑吧。

题主请自信点，题目里的“或”字可以省掉了。
关于C.37（Lambda）的研究实在太少，也太慢，但已经实锤的部分，每一条都不是好消息。

一、

Delta是怎样日穿各种疫苗免疫屏障的，想必各位已经亲眼目睹，不需要老夫多嘴了。
——而Lambda的假病毒中和试验成绩超过了B.1.617.2（delta）[1]：

第1张图片

如上图，纵坐标是中和抗体滴度（IC50），BNT162b2=俗称的辉瑞疫苗，mRNA-1273=俗称的moderna疫苗，Ad26.COV2.S=俗称的强生疫苗

哦对了，它还超过了P.1（gamma）：

第2张图片

科兴vs各种毒株的假病毒中和试验

这意味着啥，各位请品一品~

二、

各位可能还知道，delta之所以能席卷全球，是因为传染性超越了前任盟主B.1.1.7（alpha）。
而Lambda的传染性同样超越了alpha[2]：

第3张图片
或者咱看图更一目了然：

第4张图片

credit: 荷兰乌特勒支大学Henk-Jan Westeneng老师

上图是拿全球42个国家各种病毒株流行率做的meta-analysis，中间的标杆（黑色虚线）是B.1.1.7（alpha），越靠右则传染性越强。
delta排名第一没悬念；
排第二的B.1.621也牛鼻大了，甚至在局部地区已经开始反抢delta的地盘，以后有机会单独八卦；
lambda排第三。

三、

现在还没有lambda毒力方面的结论，但情况不太乐观。
——全世界唯一的lambda流行率超过50%的国家，刚好就是全世界病死率最高的国家：

第5张图片
——然后lambda在秘鲁的流行，刚好又跟当地1月份那波大爆发高度相关：

第6张图片
顺便提一句啊，各位是不是觉得4月份印度那波爆发惨绝人寰？
其实秘鲁才是真的惨，惨到你们没法想象。

四、

各位可能以为，delta是天命之选、气运之子，蛊王之王。
所以delta实力拔群，一桶浆糊纯属理所当然。
然而实际情况更可能是，delta只是传染性比同辈们略强一点而已，免疫逃逸和毒力甚至还不如同辈。
所以呢，一方面，delta固然能快速轻松取代alpha这类前辈，
另一方面，在同辈们已然站稳脚跟的地方，delta却并不一定能轻松抢到地盘。
而lambda就是众多这样的同辈之一。
——比如说，请品鉴：

第7张图片

智利

从这个角度来说，delta席卷全球，也许还不算是最坏的选项，至少delta流行的地方可看不到秘鲁那样突破天际的病死率……

五、

下面正式开始丧心病狂的贩卖焦虑环节啊~
掐指一算，delta和lambda也差不多该慢慢从后浪蜕变成前浪了。
delta的声势背后，正有无数更高更快更强的后浪正在酝酿。
比如，各位不妨关注一下全世界竞争最激烈的神仙打架现场——厄瓜多尔。
——这是截止7月25日的战况：

第8张图片
——这是截止昨天（8月4日）的战况：

第9张图片
各位不妨押个注呗，哪一家更像是后浪？

六、

继续贩卖焦虑~
当然了，更大的可能是，真正的后浪根本不是正在厄瓜多尔拼高端局的各路神仙，
而是无数正在阴暗角落暗暗蓄力的种子。
——比如说，额外洗出了P681R和T470N，一举凑齐RBD结构域三突变的P.1：

第10张图片
——比如说，同样一举凑齐RBD三突变的B.1.630：

第11张图片
——比如说，N蛋白上突然冒出8个突变的B.1.1.7：

第12张图片
——比如说，额外洗出了P686N和Q414H，RBD三突变叠加FCS双突变的delta：

第13张图片
比如说，既有RDB双突变又有FCS三突变的B.1.631：

第14张图片
类似的例子还有很多，举一天都举不完……

七、

最后再多贩卖一点焦虑得了……
这种后浪推前浪的装备竞赛，lambda是不会缺席的。
——所以一周之前，C.37.1正式现身：

第15张图片
这货长这样，红框部分是额外多出的突变：

第16张图片
请瑟瑟发抖吧。
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板凳
无_迹_可_寻 发表于 2021-8-7 05:51:52 | 只看该作者
 
Lambda会不会超过Delta成为新一代毒王？
Lambda 变异毒株最早是报告与于2020 年 8 月，地点在秘鲁。 WHO将 lambda毒株加到了VOI名单中。VOI名单是指有影响传播性、疾病严重性和免疫逃逸性的遗传变化的变体。
目前数据来看Lambda已经扩散到了超过40个国家和地区，美国、加拿大、德国、西班牙、以色列等多个地区均发现了这一毒株的身影。其中尤其是美国，已经有超过1000例感染者，应该是除了秘鲁以外第二多的国家。
大家对于Lambda的恐慌心理大多数可能是来源于秘鲁本国的死亡率。秘鲁的人均新冠死亡率位于世界第一，每10万名居民中，有596人死于新冠病毒。
从秘鲁的数据来看，该国自今年 4 月以来，报告的新增确诊病例中，有 81% 是感染了拉姆达毒株。
这两个连起来看是不是很可怕？Lambda是不是杀伤力极大？
我倒觉得没有这么吓人。
秘鲁死亡率居高不下，并不是从Lambda出现的。
在2020年8月，拥有约3200万人的秘鲁每10万人有85.8人因感染新冠病毒死亡，成为当时全球新冠死亡率最高的国家。而且，这个数字，只是基于确诊或疑似病例中的死亡人数统计，也就是说，不怎么准。
所以今年4月，秘鲁官方成立了一个小组，专门重新统计新冠死亡率。结果不查不知道，一查真的吓一跳。
该小组5月31日公布的最终报告显示，2020年3月至今年5月22日，秘鲁因感染新冠病毒死亡的人数共达180764人。而此前根据官网的数字，死亡人数才7万，差了一倍还多。
所以秘鲁的死亡率一下猛涨到了每10万人有551人因感染新冠病毒死亡。
所以秘鲁当地死亡率居高不下的原因，主要是医务人员的缺乏，以及ICU和呼吸机啊，制氧机一类的跟不上，通俗的讲就是医疗底线被击穿了。
很早就跟大家讲过新冠病毒的致死率分两个阶段，医疗底线没被击穿和击穿。秘鲁就一直处于被击穿的状态。所以为什么我们反复要强调打疫苗啊打疫苗，就是防这个。
至于大家总说的，为什么Delta这么牛逼，没有攻占秘鲁呢？
病毒传播，跟打仗不一样，并不是我冲上一个高地，地方就被全灭。
这里给大家普及一个遗传学上的概念，叫做：建立者效应（founder effect），是少数个体的基因频率决定了它们后代的基因频率。是由为数不多的几个个体建立起来的新群体所产生的一种极端的遗传漂变作用。
比如在委内瑞拉的偏僻山村中，人们患上亨丁顿舞蹈症的几率大大高于外界，因为带有亨丁顿舞蹈症基因的一位始祖妇女在早期将自己的基因播撒在个别村民中，然而其后的历史发展并没有再介入新的基因，遂导致全村的人共享了这一病态基因。
Lambda突变毒株应该就是这一原理，在秘鲁大规模扩散。所以要想看Lambda和Delta真枪实弹的打一仗，还得看美国的数据。
我们还是回头来看对于学界对于Lambda变异毒株的一些研究。
首先，这个毒株的免疫逃脱能力和传播能力都加强了。
这两个特点也是有Lambda所具有的突变引起的。
比如T76I 和 L452Q这两个突变，使得病毒的传播能力更强。
而RSYLTPGD246-253N、L452Q 和 F490S 这3个突变使得病毒的免疫逃脱能力更强。


第33张图片
这些突变中，可能最值得关注的，就是RSYLTPGD246-253N，这是一个Lambda的特有突变。也可能是导致Lambda在南美广泛传播的原因。
这个突变，是由7 个氨基酸缺失造成的，即 246-253缺失。这个突变本身对病毒的感染性影响不大，但是因为中和抗体主要是针对NTD部分，而这个确实与NTD“超级位点”的一个组成部分重叠，使得病毒具有免疫优势，增强了病毒的和抗体逃脱能力。
但与其他病毒变种的对比传播力来看，还是Delta更胜一筹。

第34张图片
新闻里边经常提到的某某变异毒株传播能力更强，或者是逃脱疫苗能力更强，其实是一个大的趋势。如果病毒不往这个方向进化，病毒就没了。
而Delta的强大传播能力，一部分是因为这2个原因，但更多的是，这个病毒的复制速度太快，以及脱落散播能力太强，所以导致频繁的发生了突破性感染。
从最新的这篇文献中，我们还看不到这方面的数据，单纯的从细胞层面的测试距离真实世界其实差的还是挺远的。所以想要系统的研究Lambda毒株，还需要更多的临床数据分析。
所以我现在的判断是，从已有的证据来看，Lambda并不会超过Delta成为新一代毒王，但我们也需要对这个变异毒株提高警惕，掌握更多的研究数据，不能在像Delta一样被打的措手不及。
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地板
爱爱牛牛 发表于 2021-8-7 05:52:04 | 只看该作者
 
不知不觉中，24个希腊字母被用掉接近一半


第37张图片
到年底24个字母够吗？
明年要启用αα、αβ？
2023年是不是该轮到  λδ 了？

建议高度重视接触高危场所的垃圾处置、交叉作业、外包和临时人员的问题

1.去年成都疫情来源于隔离点垃圾被无关人员捡走
成都郫都疫情溯源：源头是尼泊尔境外输入病例！首发病例有捡垃圾情况..._隔离
2.避免交叉作业
（1）青岛胸科医院隔离人员和日常患者共用CT室
确定因共用 CT 室感染！青岛此前已发生过新冠院感事件（2）南京机场：保洁员在国际国内机舱混合作业，保洁员们共用休息区吃饭
南京禄口机场确诊保洁员发声：清洁工具混用……_中国网（3）石家庄欧景假日酒店既承担隔离入境人员的功能，餐厅还开放给周边居民办婚宴
石家庄首例确诊者儿子发声 河北省疫情最新消息
第38张图片

第39张图片

3.高度重视临时人员的管理
（1）南京机场出问题的保洁人员是外包。
（2）郑州六院的保洁人员是临时人员，年龄偏大。
郑州 7 月 31 日通报 11 例确诊病例和 16 例无症状感染者，主要发生在医院内，情况如何？外包人员、临时工收入水平低、流动性大、规范培训较为困难，是疫情防控的薄弱环节。
建议大幅提高工资待遇，严格培训并考核，考核不合格人员全部淘汰。

4.加强对高危地点周边社区的监控
传染病防控要求“早发现，早报告、早隔离、早治疗”，最近上海浦东疫情由于发现较早，没有出现社区传播。其他地区的疫情发现较晚，防控难度很大。
如果能在国际机场、海港、陆路边境口岸、隔离点周边社区所有小诊所安排强制核酸检测，可以做到早发现，早隔离，早治疗。
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5#
坐着木筏黑八方 发表于 2021-8-7 05:53:01 | 只看该作者
 
免疫学博士来回答一下:
我先来吐槽几点:
1.哪个专家说过病毒这玩意一定百分百是越感染，感染越多毒性越弱的？你在教科书上给我找一个，这不是理论，这是自然，自然界的混沌，随机性太多，太复杂了，大气研究里有一项混沌研究，你可以看一下这玩意是有多复杂。
2.谁告诉你未来新冠一定流感化？
3.谁告诉你群体免疫等于群体不感染？
问题回答完毕，是不是突然有种毛骨悚然的感觉？
还没完呢
终极点来说，人类任何努力打算从根源上战胜都是没用的，很显然当今社会疫苗研发速度远远低于病毒变异速度，我们已经失去先机了，没用在新冠形成一定规模的时候进行群体免疫，导致现在世界战胜新冠是一件根本不可能的事。
一步慢步步慢，人类想要战胜新冠，除了赌有人能做出一个对抗中心法则的东西外，最大的可能性，只能靠病毒训化免疫系统，那会死多少人啊，迄今为止被人类消灭的病毒只有天花，人类还是太弱小了，束手无策，只有等待病毒被自然淘汰，我们就获胜了，当然代价肯定是血淋淋的。
听说你想每半年进行一次疫苗免疫？相信我不用5年，一小部分人大概率就会因为心肌炎，肾炎等困扰，你身上莫名其妙出现的炎症问题越来越多，这是已知的后果，未知的呢？遗传方向的呢？不知道，因为我是免疫学方向的，而且相关研究也无法给出答案。
所以:
难！生物科研圈里无论海外海内，对解决新冠统一都是持有悲观态度，这几年不违法的事，把口罩戴好，想干啥干啥吧，表白的表白，玩游戏的玩游戏，和亲人在一起就在一起，什么喜欢吃就多吃点，多囤点。如果得了，很难有后悔药吃，无论是身死还是活下来苟延残喘的呼吸还是社会性死亡。
很多人说我是博士，不应该如此悲观，拜托，中国有14亿人能充分利用制度的优越性集中性控制疫情，你看看你左右邻居，你能不悲观吗？毕竟世界75亿人才是大多数！我不仅是悲观，我看着世界每天增长的数字我已经麻木了，打江山容易守江山难，未来在一片变异毒株的海洋冲击里，你该怎么守？有人说闭关锁国，那美国可要哈哈大笑了，他们正是打贸易战了，你不正中下怀？我国为啥要发展全球化，一带一路？关门后我们首先最承受不住。
人类21世纪最大的挑战就是新冠，当前国内疫情的多点爆发，被动防御，地方经济坍塌，防疫断了生产工作，就是未来一角的缩影，南京这件事最大的教训除了机场防疫问题外就是震醒了我们，我们真的太和平，太松懈了，殊不知我们正在经历可能是本世纪最大的病毒大流行，会有多少条生命倒在地上呢？不得而知，预计这是以千万，亿计算。
最后告诉你们一个秘密:
期待新冠流感化，感冒化？不可能，那只是很多媒体胡乱宣传，具体你可以去了解一下鼻病毒和新冠病毒的区别。
现在最大的问题不是疫苗，而是时间尺度太短了，站在人类的历史上，一年能干啥，很多人觉得现在没啥威力，你且过个一两年再看..。

关于我回复疫苗接种安全问题请移步:https://www.zhihu.com/question/475729775/answer/2027359484
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6#
gemini丿 发表于 2021-8-7 05:53:22 | 只看该作者
 
美国新冠疫情反弹，案例激增。

今天，更让人忧心的事情出现了：

本来就足够变态的Delta病毒竟然还升级了！！

8月3日，韩联社报道称，韩国国内首次出现两例“Delta+”变种毒株感染病例。


第43张图片

第44张图片
图片来源于yahoo.news，版权属于原作者

两名病例中，一人从美国回韩，另一人为本地感染病例。

两人此前都已接种阿斯利康疫苗。

虽然目前关于Delta+变种病毒病例报告不多，但已被发现潜伏在美国、英国和印度等多个国家和地区。


第45张图片
图片来自华盛顿邮报，版权属原作者

1周72000儿童感染

前不久，印度专家指出，Delta+病毒更容易传播，更可能突破疫苗，导致更严重疾病，以及对药物产生抗药性。

但英国公共政策分析师Colin Angus认为，目前没有证据表明Delta+病毒战斗力更强，初步数据显示，接种过疫苗的人对Delta+变体仍然有效。

但Angus警告，Delta+病毒主要感染年轻人。

巧合的是，昨天，美国儿科学会透露，儿童确诊病例激增：

光上一周就有近7.2万名儿童和青少年感染新冠，是6月底的五倍。

目前不知道是否跟Delta+病毒有关


第46张图片

第47张图片
图片来源于Weill Cornell Medicine，版权属于原作者


伊利诺伊大学卫生学院传染病系主任Richard Novak透露，Delta+是在已接种疫苗的人当中，出现突破性病例时被发现的。

虽然现在谈Delta plus变体如何突破疫苗，或者是否比原来的更具传染性还为时尚早。

但却时刻警示着我们，病毒不断（变异）适应新的环境以求生存。

美国再次日增10万+

美国疫情大反弹，日均新增确诊数6个月内最高。

约翰-霍普金斯大学数据显示，今天新增106,557个病例。

过去7天日均新增病例数为90,576，比三周前报告的平均数23,613个增加了283%。

佛罗里达州、路易斯安那州、南卡病例飙升，领跑全美。

其中佛罗里达州每天平均感染人数最多，周二达到 22,145 例。住院人数为 11,515 名，创历史新高。
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7#
井凛寒 发表于 2021-8-7 05:54:13 | 只看该作者
 
这张图肯定得重做， 凑合看吧。

第53张图片

lentiviral介导的假病毒中和实验， 用spike代替了vsvg， 感染ACE2.293T
说实话我是怀疑这个的， ACE2.293T太强了， 肺上皮有那么强嘛。。

第54张图片
顺便感慨一下VSVG真强。。。。

第55张图片

https://doi.org/10.1101/2020.04.20.051219
https://doi.org/10.1016/j.celrep.2020.108528
https://doi.org/10.1101/2021.07.02.450959
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8#
jikhui0553 发表于 2021-8-7 05:54:42 | 只看该作者
 
21届毕业生真的太惨了！！
疫情本就影响经济，大量岗位流失；尤其是师范生，又赶上“双减”，真就毕业就失业....如果再有出国留学的打算，就更惨了，最可恶的是，这个人就是我！！！
本来想着延期到明年2月应该就能出去了吧，结果现在接连出现更厉害的病毒，出国是不用想了，在家等着上网课吧，而且也找不到机构老师兼职了，在家待得只剩下想毁灭了

第59张图片
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9#
zftmm 发表于 2021-8-7 05:54:48 | 只看该作者
 
资本主义只要不放弃增殖，只能把世界带入深渊，还能咋办呢？
扎好篱笆吧，南京这次就当预演了。
另外，大家熟悉一下希腊字母吧(*｀へ´*)，快用完了都，唉。
1 Α α alpha /a:lf/ 阿尔法
2 Β β beta /bet/ 贝塔
3 Γ γ gamma /ga:m/ 伽马
4 Δ δ delta /delt/ 德尔塔
5 Ε ε epsilon /ep`silon/ 伊普西龙
6 Ζ ζ zeta /zat/ 截塔
7 Η η eta /eit/ 艾塔
8 Θ θ thet /θit/ 西塔
9 Ι ι iot /aiot/ 约塔
10 Κ κ /kappa/ kap 卡帕
11 ∧ λ /lambda/ lambd 兰布达
12 Μ μ mu /mju/ 缪
13 Ν ν nu /nju/ 纽
14 Ξ ξ xi /ksi/ 克西
15 Ο ο omicron /omik`ron/ 奥密克戎
16 ∏ π pi /pai/ 派
17 Ρ ρ rho /rou/ 柔
18 ∑ σ sigma /`sigma/ 西格马
19 Τ τ tau /tau/ 套
20 Υ υ upsilon /jup`silon/ 宇普西龙
21 Φ φ phi /fai/ 佛爱
22 Χ χ chi /phai/ 西
23 Ψ ψ psi /psai/ 普西
24 Ω ω omega /o`miga/ 欧米伽
——————关于答案的个人回答———
非常非常喜欢这段话：
“嗨，同志，您知道列宁格勒和斯大林格勒在哪吗？我在地图上找不到它。”“没有了，再也没有了，我们失败了。白匪和资本家再一次骑到了我们的头上。如果你要追随那颗红星，去东方吧。穿过第聂伯河，翻过乌拉尔山脉，到西伯利亚平原的尽头，那里还燃烧着星星之火。”
“那里有一群勤劳善良的人民，他们当中仍然有那么一群人，愿意为心中的红星奋斗终生，他们把自己的理想写在了城楼上，他们不会忘记自己的初心和使命，请帮助、追随他们吧！”
这就是人类战胜疫情的答案，以上。
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10#
Jason丶华子 发表于 2021-8-7 05:55:17 | 只看该作者
 
其实，从世界范围内蔓延开始，想通过群体免疫来战胜疫情，我就觉得不靠谱。因为逃不过的一个问题就是病毒的不停变异，很可能战胜了A变种，B变种就出来了。
理论上，时间越长，病毒变异的可能性就越多。所以，如何缩短与病毒的对抗时间显得尤为重要。
消极对抗病毒的国家的情况也看得到，都有更强的变异株出现。
目前来看，中国这种分区管控，隔离感染者是一种十分高效的举措。但目前很多民众放松警惕，给了病毒可趁之机。形势严峻，需加强管控。
当然，中国的办法虽然高效，但是代价高，需要民众的配合。长远看来，收益是高于成本的。
而其他国家基本都没有像中国这样上下一条心，其他国家，一个是政策落实不到位，一个是民众的配合度不够，对自由的理解过于狭隘，再一个，一些政客把病毒问题政治化。这些都是摆在世界人民面前的问题。
只要全球贸易及人员往来一刻不停止，新冠就是全人类共同的敌人。
所以，全球对新冠问题达成共识，采取一致措施，共同行动，把战线拉到最短，即可。说来很简单，做起来很难。
现阶段来看，作为咱普通民众，能做到的就是做好自身防护，勤洗手。病毒少感染一个人，就少一次变异的机会。另外，就是配合国家的防疫政策。
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